东宫侍读齐泰等人见朱元璋如今已在犹疑，担心奏请立燕王为储的人会愈来愈多。铁铉接连上书坚持要朱元璋立朱允炆为皇太孙，朱元璋终于下定决心正式册立朱允炆为皇太孙，蓝玉和方孝孺等人组成朱允炆的东宫僚属。立储风波后朱棣在朝野的地位万分尴尬，朱元璋下诏令朱棣交卸锦衣卫差事归藩北平。朱元璋让朱允炆出京巡抚沿边诸藩，意在让朱允炆看一看何为守业之难。朱棣回到军中后在乃儿不花等人引导下，率领北平明军再次扫荡了大漠中的北元残部。