虽和五阿哥永琪（古巨基 饰）最终结为连理，但是小燕子（黄奕 饰）丝毫不改调皮顽劣的本性，伙同永琪、尔康（周杰 饰）、紫薇（马伊俐 饰）又惹出不少乱子，更时不时假传圣旨安排晴儿（王艳 饰）和萧剑（黄晓明 饰）见面。在此过程中，小燕子渐渐弄清了自己的身世，由此对永琪和一向亲近的皇阿玛产生了矛盾复杂的情怀。皇太后担心永琪的子嗣问题，遂将美女知画（秦岚 饰）送到永琪身边，也使得小燕子和永琪之间产生更大的裂痕。不久，边疆发生战乱，尔康随军南下，他和紫薇也面临着生离死别的考验……

《还珠格格第三部》剧情介绍如下：

该剧主要讲述了小燕子与五阿哥离开皇宫重回民间，经历了种种艰辛，在十几年后重遇当年的福尔康和紫薇的故事。该剧分为《天上人间》和《风儿阵阵吹》两部，播出时间是在2002年的暑假。

第一阶段讲述小燕子和五阿哥携手拯救讷言之馆和海峡两岸文化交流的大局的故事，经历了相知相遇，一直到相伴相助的深厚情谊。最后是小燕子和五阿哥为了两岸文化交流事业，为了给民族文化传承出一份力，决定放下一切，留在民间默默付出。

第二阶段讲述小燕子与五阿哥在历经了种种艰辛后，终于在十几年后重遇当年的福尔康和紫薇。小燕子用自己的言行感染着两岸人们，经过努力调解化解了人们间的纷争。与此同时，他们的爱情也在平淡的生活中升华。三人的情感线终于走向一个最自然的状态，自然就是对他们感情的最好诠释。小燕子和五阿哥的感情也逐渐沉淀、升级。经历了岁月的沉淀与洗礼，他们的感情变得真挚而深沉，双方也越来越珍惜对方。

在剧中五阿哥为两岸交流事业到处奔波，这份责任与担当也感染着身边的人。最后他们一家人共同创造了小幸福。在这过程中五阿哥的转变最大，他不再是那个纨绔子弟，而是成为了一名有责任心、有担当的好男人。

总的来说，《还珠格格第三部》是一部充满温情和责任感的电视剧，通过讲述小燕子和五阿哥的故事，展现了爱情和家庭的重要性，同时也传达了文化交流和民族团结的理念。

此外，《还珠格格第三部》的剧情中也存在一些问题和争议。一些观众认为剧情过于夸张和戏剧化，有些情节不符合现实逻辑。同时，剧中的人物形象也存在一些刻板印象和单一化的倾向，有些角色的性格和行为缺乏多样性和复杂性。这些问题在一定程度上影响了观众的观感和体验。

但是，无论如何，《还珠格格第三部》仍然是一部具有影响力的电视剧，它通过精彩的剧情和深入人心的主题，吸引了大量的观众，并成为了许多人的童年回忆。同时，该剧在文化传承和民族团结方面也发挥了一定的作用，为两岸文化交流事业做出了贡献。

总之，电视剧《还珠格格第三部》是一部充满温情和责任感的作品，它通过讲述小燕子和五阿哥的故事，展现了爱情和家庭的重要性，同时也传达了文化传承和民族团结的理念。虽然存在一些问题和争议，但该剧仍然是一部具有影响力的电视剧，为两岸文化交流事业做出了贡献。