本作主人公冈部伦太郎（宫野真守 配音）是个患有严重中二病的大学生，自称为“凤凰院凶真”的他和伙伴们组成了“未来发明研究所”，在位于秋叶原的一个简陋实验室内进行各种古怪发明和调查。

《命运石之门》是一部以时间循环为题材的科幻动漫，讲述了主角冈部伦太郎为了拯救患上“自发性膜囊炎”可能在未来消失的少女牧濑红莉栖，在尝试各种方法后发现了一种可能的路径，然而每次当他醒来时都会发现事情回到了原来的轨迹，他不断尝试、不断失败，最终他发现了真正的时空穿越机制，成功拯救了红莉栖和其他人。

故事开始时，冈部伦太郎是一个对世界充满绝望的高中生。他的朋友——椎名真由，在某次意外中离世，使他陷入更深的抑郁。某天，他在一款热门手机游戏中邂逅了名为“石之守护者”的神秘组织，受其蛊惑，冈部伦太郎第一次窥见了命运操控者——冈部伦太郎一直尝试打破时间循环，解开各种事件谜团的故事。

剧情展开，冈部伦太郎在游戏中结识了另一位神秘人物——牧濑红莉栖。红莉栖是冈部伦太郎所爱之人，也是他希望拯救的对象。在游戏中，冈部伦太郎通过一系列的冒险和挑战，逐渐揭示了时空穿越机制的真相。他发现，只有当他在特定的时间点做出正确的选择，才能阻止时间循环的发生。

然而，真正的挑战在于如何在每次循环中做出正确的决策。冈部伦太郎需要理解各种事件之间的关联，理解他的每一个选择如何影响未来的走向。他需要在这个过程中不断学习、成长，才能真正掌握时空穿越的机制。

随着剧情的发展，冈部伦太郎遇到了许多挑战和困难，但他从未放弃过。他与他的朋友们一起面对各种危机，一起寻找解决问题的方法。他们通过智慧和勇气，一次次打破了时间的束缚，最终成功拯救了红莉栖。

同时，《命运石之门》也探讨了许多深刻的主题。它展示了人类在面对命运时的挣扎和无助，以及他们如何通过团结、友情和爱情来克服困难。冈部伦太郎和他的朋友们在故事中展现了他们的勇气、智慧和牺牲精神，这使得观众对他们产生深深的同情和敬意。

此外，《命运石之门》还对时空穿越和命运的本质进行了深入的思考。它提出了许多关于人类自由意志、因果关系和命运选择的问题。观众在观看故事的同时，也会思考这些深层次的问题，从而引发对人生和命运的深度思考。

总的来说，《命运石之门》是一部充满悬疑、冒险和感人情节的动漫。它通过讲述冈部伦太郎拯救红莉栖的故事，展现了人类在面对命运时的挣扎和无助，同时也展示了友情、爱情和勇气的重要性。这部动漫不仅让观众感受到了科幻的魅力，也让他们思考了关于人生、命运和选择的深刻问题。如果你喜欢科幻、悬疑和感人情节的故事，那么《命运石之门》绝对值得一看。