在私立莉莉安女子学院里，有着这样一个制度，新入校的学生要选择一位高年级的学姐，两人结为“姐妹”，在校学习的期间，姐姐将全方位的照顾教导妹妹的生活礼仪。在学院里，山百合会的名字如雷贯耳，作为会长的小笠原祥子（伊藤美纪配音）、鸟居江利子（生天目仁美配音）和佐藤圣（封口惠美配音）三人更是学院里女生们倾慕的对象。她们被称为学院的三朵蔷薇，平日里，她们和她们的妹妹，也就是蔷薇花蕾管理着学生会里的大小事宜。平凡的少女福泽佑巳（植田佳奈配音）在误打误撞中成为了祥子的蔷薇花蕾，同时也肩负起了管理山百合会的重任。在和其他花蕾相处的过程中，又温馨又轻松的校园生活开始了。

动漫《圣母在上》剧情介绍如下：

《圣母在上》是一部少有的以女尊男卑的视觉来描写女子的动漫，不仅讲了5个女生之间的友情，更是让一群帅哥成为供其驱使的“打杂工”，圣母学院不仅是樱田纯、小早川美纪、水无濑小晶、吉住涉、佐佐木洋平五位主角的学校，也是其展示个性和表达自我的舞台。

在《圣母在上》中，樱田纯和四位美男子一同就读于名校常夏学院，其中不乏有双马尾的傲娇男主角，也有身着女装的怪力男配角，还有美得不可方物的裸足男配角等，而樱田纯则是一个从小就接受了“不论走到哪里都以恋爱为前提而行动”的教育，并且贯彻到底的男子。美男子中的一人小早川美纪就是传说中的大和抚子典型代表，虽然就读于名门淑女部，但是担任会长职务。除了这位之外，其余三人是学院内组成合唱团并兼任文化祭主办者的女主角们所依赖的支柱。身为樱田纯的保护者与贴身护卫，而跟随樱田纯一同进入圣母学院就读的小恶魔系少年音羽美智雄。还有作为美智雄的好友而入学的小白脸高野圣司，在音羽加入后成为合唱部所属的一员。另外圣母学院里的姐妹花大小姐佐佐木洋平与佐佐木百合子是一对伪兄妹。

除了樱田纯与五名主角就读的名校常夏学园外，剧情中也涉及到了名门淑女学院和男校菊之井学院，圣母学院每年都会接收来自全国各地的优秀女生入学就读，并且以培养淑女为宗旨，培养出的人才数不胜数。淑女们入学后将会被分配到宿舍内与女佣同住，并且要学习各种技能和知识。而男校菊之井学园则是为了培养照顾淑女的男性管家而设立的学园。尽管作品设定了很多淑女与绅士的形象和许多华丽的台词和字眼儿，不过是一部正统恋爱养成故事+校园日常的系列而已。在某种程度上说，可以说这部动漫里的男性都是围着女主转的。不过樱田纯的存在就是一个奇迹也是一个包袱。身为一个男性的纯作为女孩子合格了却仍然非常突出引人注目等等所以里面以男主和音羽为主出现剧情都要刻意弄些喜剧色彩而幽默成份几乎占了多半原因而且每个场景的节奏也会由这两个点起伏下去带乱而带动下面的发展出来所以可以说这是一个天然无厘头属性+各种养成系养成男配与反派萌物的欢乐日常罢了。

总之，《圣母在上》中五位女子之间友情和梦想的故事以及五位男子为守护这份友情和梦想而奋斗的故事让人感动不已。这部动漫虽然存在一些争议和负面评价，但是它依然是一部非常优秀的作品，值得一看。