故事发生在室江高中，身为剑道部的顾问，石田虎侍（小西克幸配音）每一天都过着浑水摸鱼的懒散日子，剑道这项本该令人热血沸腾的运动在他看来，不过是一群小孩子的小打小闹而已。一个契机的到来改变了石田的生活，为了赢得赌注中的一年份免费寿司，石田决定打起精神，为了赢得剑道部的大赛而奋发努力。想要重整旗鼓，就必须敞开大门招贤纳才。个头矮小却充满了正义感的川添珠姫（广桥凉配音）；性格开朗奔放，对剑道运动十分热衷的千叶纪梨乃（丰口惠美配音）；看似不良少女，实则千金大小姐的宫崎都（桑岛法子配音）；个性有些莽撞的幽灵社员桑原鞘子（小岛幸子配音），在和这些少女一同努力的过程中，石田对剑道这项运动也渐渐的产生了感情。

《竹刀少女》是一部关于少女成长、友情与奋斗的动漫。故事的主角是一位名叫小林美佐的高中女生，她生活在一个传统的剑道世家，但她对剑道没有太多兴趣。相反，她对篮球充满了热情，但因为身体条件不够优越，无法参加校队。在一个偶然的机会下，美佐结识了篮球校队的队长，一个名叫濑良的少年，他们成为了朋友。

濑良是一个天赋异禀的篮球运动员，但他却因为一次意外受伤，失去了对篮球的信心。在与美佐相处的过程中，他重新燃起了对篮球的热情，并开始教导美佐一些篮球技巧。与此同时，美佐也开始在濑良的影响下对剑道产生了兴趣，她发现自己在剑道上有着出色的天赋。

美佐和濑良一起经历了许多挑战和困难，他们共同努力，互相帮助，最终克服了各自的障碍，实现了自己的梦想。在这个过程中，他们结下了深厚的友谊，共同成长，成为了彼此生命中不可或缺的存在。

《竹刀少女》不仅展现了篮球和剑道的魅力，更深刻地描绘了青春期少年少女的内心世界和成长历程。通过美佐和濑良的故事，观众们可以感受到友情、努力和坚持的力量，以及面对困难时勇敢向前的勇气和决心。